De manera específica, la administración de la comuna de Valdivia recae sobre la Ilustre Municipalidad de Valdivia, corporación autónoma de derecho público, con personalidad jurídica y patrimonio propio. La máxima autoridad de dicha municipalidad es el alcalde Bernardo Berger (RN). El alcalde cuenta con la asesoría de un Consejo Económico y Social de carácter consultivo, además de un Concejo Municipal, compuesto por los concejales:
- Omar Sabat (UDI)
- Marcos Ilabaca (PS)
- Jorge Moya (PRSD)
- Fernando Schultz (RN)
- Gonzalo Espinoza (PDC)
- Waldemar Zúñiga (PPD)
- Patricia Martínez (Independiente/UDI)
- Miguel Massri (UDI)